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On the characterization of Brownian bridge measure on the pinned path space over a compact Riemannian manifold
期刊论文
BERNOULLI, 2022, 卷号: 28, 期号: 4, 页码: 2322-2344
作者:
Gong, Fuzhou
;
Sun, Xiaoxia
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提交时间：2023/02/07
Brownian bridge
pull back formula
integration by parts formula
characterization
BiTSC2: Bayesian inference of tumor clonal tree by joint analysis of single-cell SNV and CNA data
期刊论文
BRIEFINGS IN BIOINFORMATICS, 2022, 页码: 12
作者:
Chen, Ziwei
;
Gong, Fuzhou
;
Wan, Lin
;
Ma, Liang
收藏
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浏览/下载：20/0
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提交时间：2022/06/21
single-cell DNA sequencing
intra-tumor heterogeneity
single nucleotide variation
copy number alteration
Bayesian modeling
cancer evolution
NeuralEE: A GPU-Accelerated Elastic Embedding Dimensionality Reduction Method for Visualizing Large-Scale scRNA-Seq Data
期刊论文
FRONTIERS IN GENETICS, 2020, 卷号: 11, 页码: 8
作者:
Xiong, Jiankang
;
Gong, Fuzhou
;
Wan, Lin
;
Ma, Liang
收藏
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浏览/下载：20/0
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提交时间：2021/01/14
single-cell RNA sequencing
elastic embedding
neural networks
large-scale
stochastic optimization
parametric models
generalizable models
RobustClone: a robust PCA method for tumor clone and evolution inference from single-cell sequencing data
期刊论文
BIOINFORMATICS, 2020, 卷号: 36, 期号: 11, 页码: 3299-3306
作者:
Chen, Ziwei
;
Gong, Fuzhou
;
Wan, Lin
;
Ma, Liang
收藏
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浏览/下载：52/0
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提交时间：2020/09/23
Transfer posterior error probability estimation for peptide identification
期刊论文
BMC Bioinformatics, 2020, 卷号: 21, 期号: 1
作者:
Yi,Xinpei
;
Gong,Fuzhou
;
Fu,Yan
收藏
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浏览/下载：14/0
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提交时间：2020/05/24
Proteomics
Mass spectrometry
Quality control
Posterior error probability
Local false discovery rate
Transfer learning
Clustering phase of a general constraint satisfaction problem model d-k-CSP
期刊论文
PHYSICA A-STATISTICAL MECHANICS AND ITS APPLICATIONS, 2020, 卷号: 537, 页码: 15
作者:
Xu, Wei
;
Gong, Fuzhou
;
Zhou, Guangyan
收藏
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浏览/下载：84/0
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提交时间：2020/05/24
Constraint satisfaction problem
Solution space structure
Clustering phase transition
Problem hardness
Belief propagation
NeuralEE: A GPU-Accelerated Elastic Embedding Dimensionality Reduction Method for Visualizing Large-Scale scRNA-Seq Data
期刊论文
FRONTIERS IN GENETICS, 2020, 卷号: 11
作者:
Xiong Jiankang
;
Gong Fuzhou
;
Wan Lin
;
Ma L(马亮)
收藏
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浏览/下载：2/0
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提交时间：2021/10/26
RobustClone: a robust PCA method for tumor clone and evolution inference from single-cell sequencing data
期刊论文
BIOINFORMATICS, 2020, 卷号: 36, 期号: 11, 页码: 3299-3306
作者:
Chen Ziwei
;
Gong Fuzhou
;
Wan Lin
;
Ma L(马亮)
收藏
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浏览/下载：2/0
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提交时间：2021/10/26
DensityPath: an algorithm to visualize and reconstruct cell state-transition path on density landscape for single-cell RNA sequencing data
期刊论文
BIOINFORMATICS, 2019, 卷号: 35, 期号: 15, 页码: 2593-2601
作者:
Chen, Ziwei
;
An, Shaokun
;
Bai, Xiangqi
;
Gong, Fuzhou
;
Ma, Liang
收藏
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浏览/下载：51/0
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提交时间：2020/01/10
Multi-scale analysis of schizophrenia risk genes, brain structure, and clinical symptoms reveals integrative clues for subtyping schizophrenia patients
期刊论文
JOURNAL OF MOLECULAR CELL BIOLOGY, 2019, 卷号: 11, 期号: 8, 页码: 678-687
作者:
Ma, Liang
;
Rolls, Edmund T.
;
Liu, Xiuqin
;
Liu, Yuting
;
Jiao, Zeyu
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浏览/下载：18/0
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提交时间：2020/05/24
Schizophrenia
PANSS
multi-scale analysis
hot cluster
grey matter volume
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