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理论物理研究所 [49]
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A Decrease in Transcription Capacity Limits Growth Rate upon Translation Inhibition
期刊论文
MSYSTEMS, 2020, 卷号: 5, 期号: 5, 页码: e00575-20
作者:
Zhang, Qing
;
Brambilla, Elisa
;
Li, Rui
;
Shi, Hualin
;
Lagomarsino, Marco Cosentino
收藏
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浏览/下载：3/0
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提交时间：2020/11/26
RNA-POLYMERASE AVAILABILITY
ESCHERICHIA-COLI
RIBOSOMAL-RNA
GENE-EXPRESSION
PPGPP
EFFICIENCY
PROMOTERS
SUBUNITS
(P)PPGPP
REVEALS
Quantitative Connection between Cell Size and Growth Rate by Phospholipid Metabolism
期刊论文
CELLS, 2020, 卷号: 9, 期号: 2, 页码: 391
作者:
Zhang, Zhichao
;
Zhang, Qing
;
Guan, Shaohua
;
Shi, Hualin
收藏
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浏览/下载：64/0
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提交时间：2020/06/16
HAEMOPHILUS-INFLUENZAE RD
GRAM-NEGATIVE BACTERIA
ESCHERICHIA-COLI
OUTER-MEMBRANE
FATTY-ACID
GUANOSINE TETRAPHOSPHATE
CARDIOLIPIN SYNTHASE
ADAPTIVE EVOLUTION
ENVELOPE
MODEL
DCA for genome-wide epistasis analysis: the statistical genetics perspective
期刊论文
PHYSICAL BIOLOGY, 2019, 卷号: 16, 期号: 2, 页码: 26002
作者:
Gao, CY
;
Cecconi, F
;
Vulpiani, A
;
Zhou, HJ
;
Aurell, E
收藏
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浏览/下载：73/0
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提交时间：2019/07/19
DIRECT-COUPLING ANALYSIS
PROTEIN-STRUCTURE
CONTACTS
HIV
IDENTIFICATION
RECOMBINATION
LINKAGE
LANDSCAPE
INFERENCE
MODEL
Template-specific fidelity of DNA replication with high-order neighbor effects: A first-passage approach
期刊论文
PHYSICAL REVIEW E, 2019, 卷号: 100, 期号: 1, 页码: 12131
作者:
Li, Qiu-Shi
;
Zheng, Pei-Dong
;
Shu, Yao-Gen
;
Ou-Yang, Zhong-Can
;
Li, Ming
收藏
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浏览/下载：35/0
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提交时间：2020/06/16
MECHANISM
ENZYME
DCA for genome-wide epistasis analysis: the statistical genetics perspective
期刊论文
PHYSICAL BIOLOGY, 2019, 卷号: 16, 期号: 2, 页码: 26002
作者:
Gao, Chen-Yi
;
Cecconi, Fabio
;
Vulpiani, Angelo
;
Zhou, Hai-Jun
;
Aurell, Erik
收藏
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浏览/下载：56/0
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提交时间：2020/11/26
DIRECT-COUPLING ANALYSIS
PROTEIN-STRUCTURE
CONTACTS
HIV
IDENTIFICATION
RECOMBINATION
LINKAGE
LANDSCAPE
INFERENCE
MODEL
Correlation-compressed direct-coupling analysis
期刊论文
PHYSICAL REVIEW E, 2018, 卷号: 98, 期号: 3, 页码: 32407
作者:
Aurell, E
;
Zhou, HJ
;
Gao, CY
收藏
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浏览/下载：122/0
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提交时间：2018/12/26
STRUCTURE PREDICTION
PROTEIN-STRUCTURE
CONTACTS
IDENTIFICATION
MODEL
SEQUENCES
FAMILIES
HUMANS
Correlation-compressed direct-coupling analysis
期刊论文
PHYSICAL REVIEW E, 2018, 卷号: 98, 期号: 3, 页码: 32407
作者:
Gao, CY
;
Zhou, HJ
;
Aurell, E
收藏
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浏览/下载：203/0
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提交时间：2018/12/27
STRUCTURE PREDICTION
PROTEIN-STRUCTURE
CONTACTS
IDENTIFICATION
MODEL
SEQUENCES
FAMILIES
HUMANS
Interacting networks of resistance, virulence and core machinery genes identified by genome-wide epistasis analysis
期刊论文
PLOS GENETICS, 2017, 卷号: 13, 期号: 2, 页码: e1006508
作者:
Skwark, MJ
;
Croucher, NJ
;
Puranen, S
;
Chewapreecha, C
;
Pesonen, M
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浏览/下载：35/0
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提交时间：2017/12/21
Effects of cooperation between translating ribosome and RNA polymerase on termination efficiency of the Rho-independent terminator
期刊论文
NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 2016, 卷号: 44, 期号: 6, 页码: 2554-2563
作者:
Li, R
;
Zhang, Q
;
Li, JB
;
Shi, HL
收藏
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浏览/下载：12/0
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提交时间：2019/04/08
INTRINSIC TRANSCRIPTION TERMINATION
GENOME-WIDE ANALYSIS
ESCHERICHIA-COLI
IN-VIVO
BACTERIOPHAGE-LAMBDA
GENE-EXPRESSION
NASCENT RNA
ELONGATION
ATTENUATOR
PREDICTION
The bulk and the tail of minimal absent words in genome sequences
期刊论文
PHYSICAL BIOLOGY, 2016, 卷号: 13, 期号: 2, 页码: 26004
作者:
Aurell, E
;
Innocenti, N
;
Zhou, HJ
收藏
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浏览/下载：9/0
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提交时间：2019/04/08
minimal absent words
COMMUNITY RECONSTRUCTION
copy-mutation evolution model
EFFICIENT COMPUTATION
random sequence
SPONTANEOUS MUTATION
BACTERIA
PHYLOGENY
MATTER
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