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A systematic strategy integrating solid-phase extraction, full scan range splitting, mass defect filter and precursor ion list for comprehensive metabolite profiling of Danqi Tongmai tablet in rats 期刊论文
JOURNAL OF PHARMACEUTICAL AND BIOMEDICAL ANALYSIS, 2021, 卷号: 198, 页码: 9
作者:  Li, Zhen-wei;  Wei, Wen-long;  Li, Hao-jv;  Wu, Shi-fei;  Huang, Yong
收藏  |  浏览/下载：81/0  |  提交时间：2021/05/24
火麻仁蛋白制备、性能表征及超声改性研究 学位论文
: 中国科学院大学, 2020
作者:  徐鹏伟
收藏  |  浏览/下载：20/0  |  提交时间：2021/09/07
A simple and rapid method for blood plasma separation driven by capillary force with an application in protein detection 期刊论文
ANALYTICAL METHODS, 2020, 卷号: 12
作者:  Gao, Qingxue;  Chang, Yongjia;  Deng, Qingmei;  You, Hui
收藏  |  浏览/下载：17/0  |  提交时间：2020/11/26
An UHPLC-TOF-MS method for quantifying novel brominated anticancer compound bromophenol-thiosemicarbazone hybrid and its application to in vivo pharmacokinetic study 期刊论文
JOURNAL OF ANALYTICAL SCIENCE AND TECHNOLOGY, 2020, 卷号: 11, 期号: 1, 页码: 7
作者:  Li, Xiuxue;  Wang, Lijun;  Jia, Xiaoling;  Guo, Chuanlong;  Li, Chao
收藏  |  浏览/下载：21/0  |  提交时间：2020/09/23
Peptidyl-Lys metalloendopeptidase (Lys-N) purified from dry fruit of Grifola frondosa demonstrates "mirror"digestion property with lysyl endopeptidase (Lys-C) 期刊论文
RAPID COMMUNICATIONS IN MASS SPECTROMETRY, 2020, 卷号: 34, 期号: 2, 页码: 11
作者:  Zhao, Mingzhi;  Hao, Bingbing;  Li, Honghao;  Cai, Man;  Xie, Jingjing
收藏  |  浏览/下载：18/0  |  提交时间：2020/07/01
A survey of current trends in computational predictions of protein-protein interactions 期刊论文
FRONTIERS OF COMPUTER SCIENCE, 2020, 卷号: 14, 期号: 4, 页码: 1-9
作者:  Wang, YB (Wang, Yanbin)[ 1,2 ];  You, ZH (You, Zhuhong)[ 1 ];  Li, LP (Li, Liping)[ 1 ];  Chen, ZH (Chen, Zhanheng)[ 1,2 ]
收藏  |  浏览/下载：25/0  |  提交时间：2020/04/23
Combining High Speed ELM Learning with a Deep Convolutional Neural Network Feature Encoding for Predicting Protein-RNA Interactions 期刊论文
IEEE-ACM TRANSACTIONS ON COMPUTATIONAL BIOLOGY AND BIOINFORMATICS, 2020, 卷号: 17, 期号: 3, 页码: 972-980
作者:  Wang, L (Wang, Lei)[ 1 ];  You, ZH (You, Zhu-Hong)[ 2 ];  Huang, DS (Huang, De-Shuang)[ 3 ];  Zhou, FF (Zhou, Fengfeng)[ 4,5 ]
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离子液体/低共熔溶剂中甲壳素制备及功能化研究 学位论文
: 中国科学院大学, 2019
作者:  冯咪
收藏  |  浏览/下载：21/0  |  提交时间：2020/06/17
从废弃虾蟹壳提取的甲壳素，可用于医药、农业及纺织等领域，实现废弃资源回收，有利于可持续发展。然而，传统甲壳素及其功能化产品的制备工艺，需要大量酸碱溶液及有机溶剂，流程长，水耗大，污染大，已逐渐被淘汰。离子液体具有极低的蒸汽压、良好的热稳定性、可设计的结构及丰富的氢键网络等特点，为甲壳素制备及功能化提供了新选择。目前离子液体中甲壳素的制备及功能化研究尚少，且存在成本高、水耗大及离子液体难循环等问题。此外，尚无有关直接从虾蟹壳制备甲壳素功能化产物的报道。基于以上研究背景，本论文以虾壳为原料，开展基于离子液体/低共熔溶剂中的甲壳素、以及甲壳素/zn复合物、o-酰化甲壳素等功能化甲壳素制备的基础研究，为废弃虾壳的直接转化提供了新思路，主要研究内容及创新性研究成果如下：（1）无机盐水溶液-咪唑离子液体体系中甲壳素的制备。在此体系中，无机盐水溶液通过离子交换去除碳酸钙，离子液体1-丁基-3-甲基咪唑氯盐（[Bmim]Cl）通过氢键作用去除蛋白质及引入的杂质镍，从而制得甲壳素。考察了无机盐种类、实验温度对除钙的影响，以及实验温度、料液比对除蛋白及杂质镍的影响。结果表明，虾壳粉依次与niso4水溶液（20 Wt%）、[Bmim]Cl在130 °c反应24 H，可得到纯度为98.8 Wt%的甲壳素。由此可见，离子交换可以去除虾壳中碳酸钙，同时负载金属盐，为甲壳素/金属复合物制备提供新思路。（2）磷酸酯类离子液体-无机盐水溶液体系中甲壳素/zn复合物的制备。首先利用磷酸酯类离子液体去除虾壳中蛋白质，随后利用zn(Oac)2·2h2o水溶液去除碳酸钙同时负载锌，得到甲壳素/zn复合物。考察了磷酸酯类离子液体种类、实验温度、料液比、实验时间对除蛋白的影响，以及zn(Oac)2·2h2o水溶液浓度、实验时间、温度对除钙及负载锌的影响，初步评价了离子液体循环使用性能、甲壳素/zn复合物对pet醇解的催化性能。实验结果表明，在130 °c条件下，虾壳粉依次与1-乙基-3-甲基咪唑磷酸甲酯（[Emim][Dmp]）、zn(Oac)2·2h2o水溶液（20 Wt%）反应24 H，得到纯度为99.1 Wt%，锌含量为13.4 Wt%的甲壳素/zn复合物  所用[Emim][Dmp]循环使用五次时，仍保持原有除蛋白质能力  所得甲壳素/zn复合物，甲壳素构型为α，锌离子为znCo3/zn(Oh)2，其对pet醇解表现出良好的催化性能。由此可见，不同离子液对虾壳中蛋白质、甲壳素优先溶解能力不同。（3）金属低共熔溶剂水溶液中甲壳素/zn复合物的制备。基于以上研究思路，设计合成金属低共熔溶剂尿素/zn(Oac)2·2h2o（u-zn），其水溶液同时具备除钙、除蛋白及负载金属功能，实现了从虾壳一步制备甲壳素/zn复合物的目的。考察了u-zn水溶液浓度、料液比、实验时间及温度对产物纯度及锌负载量的影响，测试了甲壳素/zn复合物的抗菌效果，探究了u-zn水溶液与虾壳中各组分相互作用，揭示了碳酸钙去除、锌负载及蛋白质去除的机理。实验结果表明，虾壳粉与u-zn（30 Wt%）在130 °c反应24 H，可得纯度为97.2 Wt%、锌含量为34.7 Wt%的甲壳素/zn复合物，其对革兰氏阴性菌及阳性菌具有良好的抑制作用。甲壳素/zn复合物中甲壳素构型保持为α，其聚合度高于甲壳素标样，锌离子以碱式碳酸锌（zn5(Co3)2(Oh)6）的形式存在。机理研究证实，配位能力较高的锌离子与虾壳中钙离子交换，原位形成碳酸锌，然后水解为碱式碳酸锌，释放co2  虾壳中蛋白质分子被包裹于水溶液中的u-zn簇内，溶解于其中，从而去除。由此可见，u-zn水溶液的离子交换能力及聚集作用，是甲壳素/zn复合物形成的主要原因。（4）酸性低共熔溶剂中酰化甲壳素的制备。延续多功能低共熔溶剂设计的理念，设计合成11种氯化胆碱-有机酸低共熔溶剂，同时具备除钙、除蛋白、及酰化的能力，实现从虾壳一步制备酰化甲壳素的目的。考察了低共熔溶剂种类、实验温度、实验时间、料液比及水含量对酰化甲壳素纯度及酰化度的影响，评价了酸性低共熔溶剂的循环性能，测试了酰化甲壳素的抗菌及抗肿瘤效果，探究了低共熔溶剂与虾壳各组分的相互作用，明确了虾壳中碳酸钙去除、蛋白质去除及甲壳素酰化的机理。实验结果表明，虾壳粉与氯化胆碱/dl-苹果酸（1:2，chcl 1/dl-mal 2）在150 °c条件下反应3 H，得到了纯度为98.6 wt%，酰化度为0.46的o-苹果酸酰化甲壳素，其对革兰氏阳性菌及神经胶质瘤c6细胞系表现出一定抑制效果。结构分析确定，所得产物确实为o-酰化甲壳素，且其相对分子质量折合计算后高于甲壳素标样。机理研究证实，在此体系中，虾壳中碳酸钙与酸性低共熔溶剂游离出的h+反应，形成水溶性有机酸盐，同时释放co2，形成绵密气泡  虾壳中一部分蛋白质在酸性条件下降解为可溶于水的氨基酸，另一部分蛋白质与低共熔溶剂形成氢键作用，溶解于其中，转变为水溶性蛋白  甲壳素结构被低共熔溶剂撑开，反应活性提高，在h+催化下与低共熔溶剂反应，从而生成酰化甲壳素。由此可见，所用低共熔溶剂的酸度、氢键形成能力是o-酰化甲壳素生成的主要原因。  
Evaluation of the secondary structures of protein in the extracellular polymeric substances extracted from activated sludge by different methods 期刊论文
JOURNAL OF ENVIRONMENTAL SCIENCES, 2019, 卷号: 80, 页码: 128-136
作者:  Xiao, Benyi;  Liu, Yu;  Luo, Meng;  Yang, Tang;  Guo, Xuesong
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Comparison of feature extraction methods for protein-protein interactions based on deep neural networks. 期刊论文
Journal of Investigative Medicine, 2019
作者:  Wang X(王雪);  Rj Wang;  YY Wei;  YM Gui
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