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题名基于深度神经网络结构搜索的术中脑胶质瘤诊断方法研究
作者沈碧螺
答辩日期2022-05-20
文献子类硕士
授予单位中国科学院自动化研究所
授予地点中国科学院自动化研究所
导师胡振华
关键词脑胶质瘤 深度学习 近红外二区荧光成像 术中病理 网络架构搜索
学位名称工程硕士
学位专业计算机技术
英文摘要

脑胶质瘤是成人中最常见的原发性脑肿瘤,这些脑胶质瘤患者中超过一半患 有致命的胶质母细胞瘤。神经外科手术是脑胶质瘤主要的治疗方式,其总体要求 是在保护神经功能的前提下实现肿瘤的最大限度切除。但由于脑胶质瘤具有浸 润生长的特点,神经外科医生凭借术中视诊与触诊很难在肿瘤边界处鉴别肿瘤 组织与正常组织,所以很容易导致肿瘤残留或患者功能区损伤。术中冰冻病理是 一种常规的诊断方法,可获得组织良恶性、肿瘤分级与 Ki-67 等信息,从而指导 手术切除与术后早期治疗策略制定。但它通常需要耗费很长时间(至少 20-30 分 钟),同时存在采样误差,而且需要专业的病理科医生配合对病理切片进行解读。 临床迫切需要一种新技术,可以自动对脑胶质瘤患者组织标本进行快速、准确的 术中诊断。

深度学习方法为脑胶质瘤术中快速诊断提供了新思路。通过结合深度学习与 近红外二区(NIR-II,near-infrared window II)荧光成像,使用深度神经网络自 动捕获荧光图像中的特征,将其与病理金标准建立关联,有望从中挖掘出更多肿 瘤相关信息,实现脑胶质瘤组织标本的术中快速、精确诊断。在此基础上,通过 使用网络架构搜索技术,针对性地优化网络结构,可以增强模型特征提取能力, 进一步提升术中诊断效果。总的来说,本文的主要工作和贡献概括如下:

(1) 针对脑胶质瘤组织术中快速、精确诊断的问题, 提出了一种基于 EfficientNet 迁移学习的术中脑胶质瘤诊断方法。该方法使用 ImageNet 预训练的 EfficientNet 网络在脑胶质瘤组织术中近红外二区荧光图像上进行迁移学习,通 过多种数据增强方法与加权损失函数缓解了训练过拟合与类别不平衡的问题, 实现了术中肿瘤组织和正常组织的快速鉴别,模型在测试集上的受试者工作特 征曲线下面积(AUC,area under receiver operating characteristic curve)可达 0.945。 同时该方法可以在术中实时提供肿瘤分级与 Ki-67 信息,AUC 分别达到 0.810 与 0.625。

(2) 针对手工设计专用网络结构过程较为复杂的问题,提出了一种卷积神经网络即插即用模块搜索方法 PP-NAS。该方法首先提出了一个新搜索空间 PPConv,可用于搜索即插即用模块。PPConv 可以很容易地整合到现有网络结构 中,提升模型多尺度特征提取能力。同时提出了一种基于单层优化的可微搜索算 法,通过使用额外的损失函数,减小了搜索阶段与评估阶段的优化间隙,提升了 搜索效果。搜索得到的网络在自然图像的图像分类、目标检测、语义分割等多个 任务上进行了验证,效果均优于对比网络模型。

(3) 针对术中脑胶质瘤组织的肿瘤鉴别、肿瘤分级、Ki-67 水平预测等问 题,在 PP-NAS 方法的基础上,根据脑胶质瘤术中组织荧光图像的特点,对搜索 空间进行了改进,并使用基于单层优化的搜索算法在脑胶质瘤数据集上开展了 搜索实验,进一步优化了模型结构,得到了更适合处理术中组织荧光图像的网络 结构,在肿瘤鉴别、肿瘤分级与 Ki-67 水平预测等任务上都取得了效果提升。

综上所述,针对脑胶质瘤术中诊断问题,本文提出了基于迁移学习与多尺度 即插即用模块搜索的术中脑胶质瘤诊断方法,在单中心脑胶质瘤数据集上进行 了验证,结果表明所提出的方法在术中肿瘤鉴别、肿瘤分级与 Ki-67 水平预测上 取得了良好的效果,有望在术中为医生提供帮助。

语种中文
页码75
内容类型学位论文
源URL[http://ir.ia.ac.cn/handle/173211/48668]  
专题毕业生_硕士学位论文
推荐引用方式
GB/T 7714
沈碧螺. 基于深度神经网络结构搜索的术中脑胶质瘤诊断方法研究[D]. 中国科学院自动化研究所. 中国科学院自动化研究所. 2022.
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