比较转录组研究钛离子对紫花苜蓿基因表达的影响

doi:10.19675/j.cnki.1006-687x.2018.04028

CORC > 成都生物研究所 > 中国科学院成都生物研究所 > 食品安全与环境治理领域 > 农业生物技术研究

	比较转录组研究钛离子对紫花苜蓿基因表达的影响
	魏春梅 1,2; 栾威 1,2; 代娅 2; 王明秀 2; 陶向 2; 王艳 2; 李彩侠 2; 马欣荣 2
刊名	应用与环境生物学报
	2019
卷号	25 期号:1 页码:117-127
关键词	钛离子紫花苜蓿基因差异表达核糖体蛋白热激蛋白抗病相关基因 WRKY基因
ISSN号	1006-687X
DOI	10.19675/j.cnki.1006-687x.2018.04028
其他题名	Effects of titanium ions on gene expression of Medicago sativa by comparative transcriptome analysis
产权排序	1
文献子类	Article
英文摘要	钛离子可显著促进植物生长,增加作物产量.以紫花苜蓿(Medicago sativa)为材料,用钛离子水溶液(0,8mg/L)喷施植株叶面,24h后取样进行Illumina高通量RNA-Seq测序,研究钛离子对紫花苜蓿叶片基因表达的影响,在转录水平上研究钛离子作用的分子机理.以蒺藜苜蓿(Medicago truncatula)为参考基因组进行比对,结果显示,共获得28437个注释基因.差异表达分析表明,与对照相比,8mg/L钛离子处理引起大量基因表达发生变化,482个差异表达的基因中247个上调表达,235个下调表达.GO和KEGG注释结果显示,大量核糖体(18)、热激蛋白(7)、转录因子WRKY(5)类编码基因上调表达;尽管抗病相关基因上调的个数(11)低于下调的(22),但这些抗病相关基因的总体表达量,FPKM从12563上升至16197.下调的基因主要有细胞色素P450家族基因(上调2个,下调7个).推测钛离子作为一种胁迫信号刺激紫花苜蓿产生应答,引起基因表达发生变化,上调了与生长和胁迫适应相关基因的表达,进而促进植物生长和提高对逆境的耐受性.本研究为揭示钛离子调节植物生长的机制打下基础,为进一步钛离子制剂在农业生产中的应用提供指导.
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WOS研究方向	Agriculture (provided by Clarivate Analytics)
语种	中文
CSCD记录号	CSCD:6442149
内容类型	期刊论文
源URL	[http://210.75.237.14/handle/351003/30764]
专题	环境治理与食品安全领域_农业生物技术研究
通讯作者	马欣荣
作者单位	1.中国科学院大学 2.中国科学院成都生物研究所;
推荐引用方式 GB/T 7714	魏春梅,栾威,代娅,等. 比较转录组研究钛离子对紫花苜蓿基因表达的影响[J]. 应用与环境生物学报,2019,25(1):117-127.
APA	魏春梅.,栾威.,代娅.,王明秀.,陶向.,...&马欣荣.(2019).比较转录组研究钛离子对紫花苜蓿基因表达的影响.应用与环境生物学报,25(1),117-127.
MLA	魏春梅,et al."比较转录组研究钛离子对紫花苜蓿基因表达的影响".应用与环境生物学报 25.1(2019):117-127.