长牡蛎17个fosmid-SSR标记的开发与分析

	长牡蛎17个fosmid-SSR标记的开发与分析
	李慧娟 ; 亓海刚 ; 李莉 ; 闫喜武 ; 张国范
刊名	水产学报
	2011
期号	10 页码:1463-1468
关键词	长牡蛎简单重复序列基因组遗传多样性
中文摘要	研究所用序列由长牡蛎fosmid文库末端测序获得。首先用TRF程序扫描序列获得一批重复单元为2碱基的候选SSR位点,然后在部分SSR序列两侧的保守区设计50对引物,对取自山东青岛的一个长牡蛎野生群体进行基因型分析。结果显示,共有17个SSR位点显示多态性,等位基因数(Na)平均为4,有效等位基因数(Ne)平均为2.82,平均杂合度观测值(Ho)和期望值(He)分别为0.395 9和0.628 8。其中,11个位点的多态信息含量(PIC)值均大于0.5,共有49个等位基因,适合对长牡蛎群体遗传结构的分析;6个位点0.25
语种	中文
公开日期	2013-09-27
内容类型	期刊论文
源URL	[http://ir.qdio.ac.cn/handle/337002/13066]
专题	海洋研究所_海洋生物技术研发中心
推荐引用方式 GB/T 7714	李慧娟,亓海刚,李莉,等. 长牡蛎17个fosmid-SSR标记的开发与分析[J]. 水产学报,2011(10):1463-1468.
APA	李慧娟,亓海刚,李莉,闫喜武,&张国范.(2011).长牡蛎17个fosmid-SSR标记的开发与分析.水产学报(10),1463-1468.
MLA	李慧娟,et al."长牡蛎17个fosmid-SSR标记的开发与分析".水产学报 .10(2011):1463-1468.