表皮葡萄球菌双组分调控系统的生物信息学分析 | |
秦智强4; 钟扬1; 张健2; 何有裕3; 吴旸4; 江娟4; 陈洁敏4; 罗小民2; 瞿涤4 | |
刊名 | Chinese science bulletin |
2004 | |
卷号 | 49期号:10页码:948-952 |
关键词 | 表皮葡萄球菌 双组分调控系统 组氨酸蛋白激酶 反应调节蛋白 生物信息学 药物靶标 |
ISSN号 | 0023-074X |
文献子类 | Article |
英文摘要 | 应用序列同源性比较及功能域分析等生物信息学手段, 从表皮葡萄球菌全基因组序列中发现16对双组分调控系统以及2个相对保守的功能域(HATPase_c和REC). 通过与金黄色葡萄球菌和枯草杆菌中的双组分调控系统基因比较, 预测表皮葡萄球菌中同源双组分调控系统基因可能具有参与调控细菌生长、生物膜形成、毒力因子表达等重要生物学功能. 对16对双组分调控系统基因的2个保守性功能域进行空间结构模建, 获得4个相似的组氨酸蛋白激酶HATPase_c功能域模拟结构以及13个相似的反应调节蛋白REC功能域模拟结构, 其中HATPase_c结构在AMP-PNP的结合部位形成袋状结构, 而REC结构中均包含3个天冬氨酸活性位点. 初步实验结果表明表皮葡萄球菌双组分调控系统保守性功能域的生物信息学分析可以为进一步开发相关治疗药物提供潜在的靶标. |
资助项目 | 本工作为国家高技术研究发展计划[00000000] ; 国家重点基础研究发展规划[00000000] ; 上海市科技发展基金资助项目[00000000] |
WOS研究方向 | General & Internal Medicine (provided by Clarivate Analytics) |
语种 | 中文 |
CSCD记录号 | CSCD:1855870 |
内容类型 | 期刊论文 |
源URL | [http://119.78.100.183/handle/2S10ELR8/268413] |
专题 | 药物发现与设计中心 |
作者单位 | 1.复旦大学生命科学学院, 生物多样性与生态工程教育部重点实验室, 上海 200433, 中国.; 2.中国科学院上海药物研究所药物发现与设计中心, 上海 201203, 中国.; 3.中国科学院上海生命科学研究院生物信息中心, 上海 200031, 中国. 4.复旦大学医学院, 教育部卫生部分子病毒重点实验室, 上海 200032, 中国.; |
推荐引用方式 GB/T 7714 | 秦智强,钟扬,张健,等. 表皮葡萄球菌双组分调控系统的生物信息学分析[J]. Chinese science bulletin,2004,49(10):948-952. |
APA | 秦智强.,钟扬.,张健.,何有裕.,吴旸.,...&瞿涤.(2004).表皮葡萄球菌双组分调控系统的生物信息学分析.Chinese science bulletin,49(10),948-952. |
MLA | 秦智强,et al."表皮葡萄球菌双组分调控系统的生物信息学分析".Chinese science bulletin 49.10(2004):948-952. |
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