基于四种水产病原弧菌的简型芯片检测体系的优化

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	基于四种水产病原弧菌的简型芯片检测体系的优化
	朱鹏飞 1; 李壹 1; 王宗灵 1; 曲凌云 1
刊名	海洋科学进展
	2015
卷号	33 期号:2 页码:257-269
关键词	弧菌基因芯片点样液优化 vibrio DNA microarray spotting buffer optimization
ISSN号	1671-6647
英文摘要	基因芯片技术在病原菌检测领域展现出良好的前景,本文依托水产病原菌基因检测芯片的检测体系,以水产常见病原弧菌的hs p60、to x R基因检测探针为研究对象,系统研究不同点样液配方、寡核苷酸探针浓度、荧光标记物质浓度、杂交温度、杂交时长对芯片杂交效果的影响,并进行相应优化。结果表明,杂交温度为60℃、杂交时长为2 h、探针浓度为1mumol/L、Cy3标记的随机引物的用量为150 pmol时,芯片的经济性、灵敏度、检测效率达到均衡;以0.1 mol/L磷酸氢二钠和25%二甲基亚砜混合溶液作为点样液,效果较好。优化后的芯片对4种弧菌的检测没有出现交叉杂交现象,探针特异性达到100%;对溶藻弧菌全基因组DNA检测灵敏度为10 fg, 高出PCR方法约2个数量级。
资助项目	国家海洋局海洋公益性行业科研专项-重要鱼类增养区致病细菌基因芯片检测技术研究开发与示范 ; 国家科技支撑计划-海洋水产病毒实用化检测及预警技术的建立与应用
WOS研究方向	Biochemistry & Molecular Biology
语种	中文
CSCD记录号	CSCD:5427477
内容类型	期刊论文
源URL	[http://ir.fio.com.cn/handle/2SI8HI0U/5954]
专题	业务部门_海洋生态研究中心
作者单位	1.国家海洋局第一海洋研究所, 青岛, 山东 266061, 中国 2.国家海洋局第一海洋研究所, 青岛, 山东 266061, 中国 3.国家海洋局第一海洋研究所, 青岛, 山东 266061, 中国 4.国家海洋局第一海洋研究所, 青岛, 山东 266061, 中国
推荐引用方式 GB/T 7714	朱鹏飞,李壹,王宗灵,等. 基于四种水产病原弧菌的简型芯片检测体系的优化[J]. 海洋科学进展,2015,33(2):257-269.
APA	朱鹏飞,李壹,王宗灵,&曲凌云.(2015).基于四种水产病原弧菌的简型芯片检测体系的优化.海洋科学进展,33(2),257-269.
MLA	朱鹏飞,et al."基于四种水产病原弧菌的简型芯片检测体系的优化".海洋科学进展 33.2(2015):257-269.