广藿香α-淀粉酶PcAMY1基因克隆和序列分析

	广藿香α-淀粉酶PcAMY1基因克隆和序列分析
	王瑛 3; 欧阳蒲月 1; 刘永亮 2; 严振 1
刊名	热带作物学报
	2014
卷号	35 期号:04 页码:746-752
关键词	广藿香 α-淀粉酶 PcAMY1基因基因克隆生物信息学分析
英文摘要	为了解广藿香对淀粉的利用,克隆了广藿香(Pogostemon cablin)的α-淀粉酶(alpha-amylase,AMY)基因,对其进行相关生物信息学分析。搜索本课题组建立的广藿香转录组数据库,获得AMY基因全长序列,并设计全长引物进行PCR验证;利用生物信息学软件对AMY基因进行生物信息学分析。本研究获得的广藿香AMY基因命名为PcAMY1基因(GenBank登录号为KC862311),该基因全长1 420 bp,编码422个氨基酸。基于生物信息软件分析了PcAMY1基因编码蛋白的理化特性。系统进化树分析结果表明,PcAMY1基因与牵牛(Ipomoea nil)的AMY序列同源性最高,与赤豆(Vigna angularis)、菜豆(haseolus vulgaris)、蒺藜苜蓿(Medicago truncatula)等植物次之,与自然进化关系保持一致。PcAMY1基因在广藿香嫩茎、成熟茎、老茎、嫩叶、成熟叶、老叶中均有表达,但在老茎中表达量最高。成功克隆到广藿香PcAMY1基因,并对其进行相关生物信息学与基因表达分析。
语种	中文
内容类型	期刊论文
源URL	[http://210.77.82.179/handle/2SCSIERX/1427]
专题	研究领域
作者单位	1.广东食品药品职业学院，广东广州 210520; 2.中国科学院武汉植物园，湖北武汉 430075; 3.中国科学院华南植物园，广东广州 510650
推荐引用方式 GB/T 7714	王瑛,欧阳蒲月,刘永亮,等. 广藿香α-淀粉酶PcAMY1基因克隆和序列分析[J]. 热带作物学报,2014,35(04):746-752.
APA	王瑛,欧阳蒲月,刘永亮,&严振.(2014).广藿香α-淀粉酶PcAMY1基因克隆和序列分析.热带作物学报,35(04),746-752.
MLA	王瑛,et al."广藿香α-淀粉酶PcAMY1基因克隆和序列分析".热带作物学报 35.04(2014):746-752.