棉花MAPKs 家族成员的聚类分析

doi:10.11963/issn.1002-7807.201605001

	棉花MAPKs 家族成员的聚类分析
	郭慧敏 1; 翟伟卜 1; 张珊珊 1; 郭安慧 1; 张文蔚 1; 简桂良 1; 段江燕 2; 齐放军 1
刊名	棉花学报
	2016
卷号	28 期号:5 页码:425-433
关键词	陆地棉雷蒙德氏棉亚洲棉 MAPKs 生物信息学同源比对聚类分析
ISSN号	1002-7807
DOI	10.11963/issn.1002-7807.201605001
其他题名	Phylogenetic Analysis of Cotton MAPK Family Members
英文摘要	MAP激酶(促分裂原活化蛋白激酶)级联信号通路(MAPKs)由3种级联磷酸化的蛋白激酶MAPKKK、 MAPKK和MAPK组成,在调控植物的生长发育、胁迫响应及抗病反应等过程中都起重要作用。为了全面了解棉花MAPK、MAPKK、MAPKKK家族各成员间的关系,进而研究和揭示MAPKs在棉花抗病、抗逆中的作用,利用已公布的雷蒙德氏棉和亚洲棉基因组数据,并从NCBI数据库中收集陆地棉的MAPKs氨基酸序列,运用生物信息学的方法对棉花(陆地棉、雷蒙德氏棉、亚洲棉)MAPK、MAPKK和MAPKKK家族的氨基酸序列进行了同源比对和聚类分析。结果表明:棉花MAPK家族具有特征性结构TEY磷酸化位点或TDY磷酸化位点,依据其氨基酸序列可划分为A、B、C和D族,其中TEY类包含A、B和C族,TDY类只包含D族;棉花MAPKK家族具有特征性保守区域S/T-X5-S/T和活性部位基序D(I/L/V)K,并依据其氨基酸序列也可将其划分为 A、B、C和D族;棉花MAPKKK家族具有MEKK特征性保守区域G(T/S)PX(W/Y)MAPEV和Raf特征性保守区域GTXX (W/Y)MAPE (L/V),进而分为MEKK类和Raf类2组亚群。本研究梳理了棉花MAPKs中的 MAPK、MAPKK、MAPKKK家族各成员间的关系,为进一步研究棉花MAPKs信号传导途径和揭示其在棉花抗病、抗逆中的作用提供了基础信息。
学科主题	农作物
语种	中文
内容类型	期刊论文
源URL	[http://ir.nais.net.cn/handle/2HMLN22E/136841]
专题	植物保护研究所_植物病害研究室
作者单位	1.中国农业科学院植物保护研究所, 植物病虫害生物学国家重点实验室, 北京, 100193; 2.山西师范大学生命科学学院, 山西, 临汾, 041004
推荐引用方式 GB/T 7714	郭慧敏,翟伟卜,张珊珊,等. 棉花MAPKs 家族成员的聚类分析[J]. 棉花学报,2016,28(5):425-433.
APA	郭慧敏.,翟伟卜.,张珊珊.,郭安慧.,张文蔚.,...&齐放军.(2016).棉花MAPKs 家族成员的聚类分析.棉花学报,28(5),425-433.
MLA	郭慧敏,et al."棉花MAPKs 家族成员的聚类分析".棉花学报 28.5(2016):425-433.