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水稻功能基因组育种数据库(RFGB):3K水稻SNP与InDel子数据库
郑天清1; 余泓2; 张洪亮3; 吴志超1; 王文生1; 太帅帅4; 迟璐1; 阮珏5; 韦朝春6; 石建新6
刊名科学通报
2015
卷号60期号:4页码:367-371
关键词3K水稻 单核苷酸多态性 插入缺失 基因组育种 数据库
ISSN号0023-074X
其他题名Rice functional genomics and breeding database (RFGB): 3K-rice SNP and InDel sub-database
英文摘要水稻是全世界最重要的粮食作物之一.对全球水稻品种资源进行基因组研究, 挖掘有利等位基因和指导基于全基因组信息的分子育种具有重大的理论和实践意义, 是关系国家乃至全球粮食安全的重大战略问题.本研究通过全球3000份水稻资源(3K水稻)的全基因组重测序, 获取了其中质量较好的2859份水稻基因组的单核苷酸多态性(SNP)及小片段插入缺失(InDel)的基因组变异数据, 建立了综合性的水稻功能基因组育种数据库的SNP与InDel多态性子数据库.该子数据库包含了3K水稻多态性信息检索、基因组浏览器可视化系统、特定区段基因组数据导出系统等多项功能.本数据库的建立将为研究水稻基因功能、指导水稻全基因组选择育种提供重要平台.
学科主题农作物
语种中文
内容类型期刊论文
源URL[http://ir.nais.net.cn/handle/2HMLN22E/129124]  
专题作物科学研究所_分子生物学系
作者单位1.中国农业科学院作物科学研究所, 国家作物基因资源与遗传改良重大科学工程, 北京, 100081;
2.中国科学院遗传与发育生物学研究所, 北京, 100101;
3.中国农业大学植物遗传育种系, 北京市作物遗传改良重点实验室, 北京, 100193;
4.深圳华大基因研究院, 深圳, 518083;
5.中国农业科学院深圳农业基因组研究所, 深圳, 518120;
6.上海交通大学生命科学技术学院, 上海, 200240;
7.T. T. Chang Genetic Resources Center, IRRI, Philippines, Laguna, 4031
推荐引用方式
GB/T 7714
郑天清,余泓,张洪亮,等. 水稻功能基因组育种数据库(RFGB):3K水稻SNP与InDel子数据库[J]. 科学通报,2015,60(4):367-371.
APA 郑天清.,余泓.,张洪亮.,吴志超.,王文生.,...&黎志康.(2015).水稻功能基因组育种数据库(RFGB):3K水稻SNP与InDel子数据库.科学通报,60(4),367-371.
MLA 郑天清,et al."水稻功能基因组育种数据库(RFGB):3K水稻SNP与InDel子数据库".科学通报 60.4(2015):367-371.
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