割手密醛脱氢酶ScALDH基因的克隆与表达分析

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	割手密醛脱氢酶ScALDH基因的克隆与表达分析
	申明明; 程志远; 陈疏影; 王先宏; 何丽莲; 李富生
刊名	广西植物
	2017-03-15
期号	03 页码:380-387
关键词	割手密基因克隆序列分析干旱胁迫 real time-PCR
ISSN号	1000-3142
英文摘要	该研究从甘蔗细茎野生种(割手密Saccharum spontaneum)中克隆抗旱相关的基因Sc ALDH,并分析其在干旱处理条件下的表达情况和序列特征。利用RT-PCR技术克隆甘蔗的ALDH基因片段,并对其核苷酸和氨基酸序列进行分析。使用NCBI Blastx、ORF finder、Mega、NCBI Conserved Domain Search等程序对其分别进行不同物种氨基酸比较、开放阅读框(ORF)寻找、进化树及保守序列分析,并用Real Time-PCR分析所克隆基因在干旱胁迫前后的表达差异。结果表明:克隆出甘蔗的ALDH基因片段,总长度为1996bp,其中蛋白质编码区(CDS)全长1524bp,编码508个氨基酸;与其它物种ALDH类蛋白氨基酸序列有很高的同源性,有ALDH家族的保守序列,并含有完整的开放阅读框,系统进化树分析显示与玉米的蛋白质亲缘关系最近;Real timePCR数据表明,在干旱胁迫下,随着干旱时间的延长,该基因的表达量呈持续积累的表达模式。总体上来说,该基因对干旱胁迫显著表达。利用RT-PCR技术克隆的甘蔗ALDH基因,属于ALDH蛋白家族的一员,具有其典型的功能域,该基因在干旱胁迫过程中参与抗旱作用。该研究结果为野生种资源开发、优良抗旱亲本选择和培育抗旱性强甘蔗品种提供了参考依据。
分类号	Q943
语种	中文
内容类型	期刊论文
源URL	[http://ir.nais.net.cn/handle/2HMLN22E/127672]
专题	作物科学研究所
作者单位	云南农业大学农学与生物技术学院;中国农业科学院作物科学研究所
推荐引用方式 GB/T 7714	申明明,程志远,陈疏影,等. 割手密醛脱氢酶ScALDH基因的克隆与表达分析[J]. 广西植物,2017(03):380-387.
APA	申明明,程志远,陈疏影,王先宏,何丽莲,&李富生.(2017).割手密醛脱氢酶ScALDH基因的克隆与表达分析.广西植物(03),380-387.
MLA	申明明,et al."割手密醛脱氢酶ScALDH基因的克隆与表达分析".广西植物 .03(2017):380-387.