轮枝镰孢SSR标记开发及在玉米分离群体遗传多样性分析中的应用

	轮枝镰孢SSR标记开发及在玉米分离群体遗传多样性分析中的应用
	任旭; 朱振东; 李洪杰; 段灿星; 王晓鸣
刊名	中国农业科学
	2012
卷号	45 期号:1 页码:52-66
关键词	轮枝镰孢简单串联重复序列玉米分离物遗传多样性
ISSN号	0578-1752
其他题名	SSR Marker Development and Analysis of Genetic Diversity of Fusarium verticillioides Isolated from Maize in China
英文摘要	【目的】开发轮枝镰孢(Fusarium verticillioides)的SSR标记,为轮枝镰孢遗传多样性研究提供技术支持。【方法】利用Fastpcr在轮枝镰孢基因组中查找符合条件的SSR位点,采用Primer5.0软件设计引物,利用NTSYS及Popgene分析来自玉米的轮枝镰孢单孢分离物群体的PCR扩增结果。【结果】共设计有效扩增SSR引物158对,经筛选,109对(69.0%)可扩增出2条及以上的条带,其中55对引物(34.8%)多态性较好,可扩增出3条及以上的条带。从11条已组装的轮枝镰孢染色体上各选出2对多态性引物,计22对引物,对66株轮枝镰孢玉米分离物进行扩增,共获得125个等位变异,变异范围为2—11个,平均为5.68个。轮枝镰孢玉米分离物之间Nei’s基因多样性指数为0.1139—0.8687,平均为0.6199,表现出较高的遗传多样性。【结论】基于轮枝镰孢基因组序列开发的SSR标记具有很好的多态性,可用于轮枝镰孢的遗传多样性分析。用22对SSR引物扩增,以遗传相似系数0.3进行划分,可将66株轮枝镰孢玉米分离物分为3群;中国轮枝镰孢玉米分离物的遗传多样性与地理分布无相关性。
学科主题	农作物
语种	中文
内容类型	期刊论文
源URL	[http://111.203.20.206/handle/2HMLN22E/852]
专题	作物科学研究所_种质资源保存与研究中心
作者单位	中国农业科学院作物科学研究所国家农作物基因资源与基因改良重大工程, 北京, 100081
推荐引用方式 GB/T 7714	任旭,朱振东,李洪杰,等. 轮枝镰孢SSR标记开发及在玉米分离群体遗传多样性分析中的应用[J]. 中国农业科学,2012,45(1):52-66.
APA	任旭,朱振东,李洪杰,段灿星,&王晓鸣.(2012).轮枝镰孢SSR标记开发及在玉米分离群体遗传多样性分析中的应用.中国农业科学,45(1),52-66.
MLA	任旭,et al."轮枝镰孢SSR标记开发及在玉米分离群体遗传多样性分析中的应用".中国农业科学 45.1(2012):52-66.