大麦Amy32b的遗传多样性及其对α-淀粉酶活性的影响 | |
姜晓东; 张京; 郭刚刚 | |
刊名 | 中国农业科学
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2012 | |
卷号 | 45期号:5页码:823-831 |
关键词 | 大麦 Amy32b 编码区单核苷酸多态性 α-淀粉酶活性 |
ISSN号 | 0578-1752 |
其他题名 | Polymorphism of the Amy32b Gene and Its Effect on the α-Amylase Activity in Barley |
英文摘要 | 【目的】通过对Amy32b遗传多样性研究,发掘与α-淀粉酶活性相关的等位变异。【方法】设计能够覆盖Amy32b序列的特异引物,研究该基因在中国大麦的等位变异类型:单核苷酸多态性位点(SNP)及插入(insert)、缺失(delete)等。利用RT-PCR获得Amy32b的全长cDNA序列,分别将携带等位变异的全长cDNA和截短cDNA连入表达载体pET-28a(+),并对表达产物进行纯化、活力测定及比较研究。【结果】根据对已公布的Amy32b(x05166)的扩增,发现在基因编码区有一多态性位点G/A(cSNP)和1个A碱基的插入/缺失突变。分别位于Amy32b的碱基序列2 269 bp和2 403 bp,其中,G/A转换导致第355位氨基酸由谷氨酸(E)替换为赖氨酸(K);A碱基插入导致终止密码的形成,引发了碱基片段缺失以及编码氨基酸序列和α-淀粉酶蛋白C端的提前终止。克隆出Amy32b全长和截短cDNA,长度分别为1 314 bp和1 266 bp。酶活性测定结果表明,两种全长重组酶(rAmy32b_A和rAmy32b_G)均具有正常且相同的淀粉酶活性,而截短的突变酶(rΔAmy32b)未能测出淀粉酶活性。【结论】Amy32b的碱基插入/缺失突变形成终止子,引发碱基片段缺失和编码α-淀粉酶C端截短,造成酶活性的丧失;而G/A转换造成的氨基酸替换则对该酶活性没有影响。 |
学科主题 | 农作物 |
语种 | 中文 |
内容类型 | 期刊论文 |
源URL | [http://111.203.20.206/handle/2HMLN22E/725] ![]() |
专题 | 作物科学研究所_种质资源保存与研究中心 |
作者单位 | 中国农业科学院作物科学研究所, 北京, 100081 |
推荐引用方式 GB/T 7714 | 姜晓东,张京,郭刚刚. 大麦Amy32b的遗传多样性及其对α-淀粉酶活性的影响[J]. 中国农业科学,2012,45(5):823-831. |
APA | 姜晓东,张京,&郭刚刚.(2012).大麦Amy32b的遗传多样性及其对α-淀粉酶活性的影响.中国农业科学,45(5),823-831. |
MLA | 姜晓东,et al."大麦Amy32b的遗传多样性及其对α-淀粉酶活性的影响".中国农业科学 45.5(2012):823-831. |
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