坛紫菜EST-SSR分子标记的开发及应用 | |
谢潮添 ; 陈昌生 ; 纪德华 ; 徐燕 | |
2012-06-06 ; 2012-06-06 | |
会议名称 | 中国云南昆明 2008年中国水产学会学术年会 |
关键词 | 坛紫菜 EST-SSR 微卫星 遗传变异 Porphyra haitanensis EST-SSR microsatellite genetic variation S968.431 |
其他题名 | Development and exploitation of EST-derived microsatellites in Porphyra haitanensis Chang et Zheng(Bangiales,Rhodophyta) |
中文摘要 | 采用生物信息学方法对NCBI数据库上公开的坛紫菜(Porphyra haitanensis)ESTs序列进行EST-SSRs特征分析,剔除冗余序列,得到非冗余序列3489条。在非冗余序列中发现其中210条EST序列中含有不同重复基元的SSRs 224个。在各种重复基元中,三核苷酸重复基元的SSRs出现频率最高(64.29%),其次是二核苷酸(33.48%),四核苷酸、五核苷酸和六核苷酸重复基元出现; The frequency,type and distribution of simple sequence repeats(SSRs) in Porphyra haitanensis genomes was investigated using the Expressed Sequence Tags(EST) sequence data, deposited in public database; 【会议名称】2008年中国水产学会学术年会 【会议时间】2008-11 【会议地点】中国云南昆明 【主办单位】中国水产学会 【会议录名称】2008年中国水产学会学术年会论文摘要集 【作者机构】集美大学水产学院; 【作者英文名】Xie Chao-Tian,Chen Chang-Sheng*,Ji De-Hua,Xu Yan College of Fisheries,Jimei University,Xiamen 361021,China |
会议录 | http://epub.edu.cnki.net/grid2008/brief/detailj.aspx?filename=ogsb200811001180&dbcode=CPFD&dbname=CPFD2009 |
语种 | 中文 |
内容类型 | 会议论文 |
源URL | [http://ir.calis.edu.cn/hdl/235041/21469] |
专题 | 集美大学 |
推荐引用方式 GB/T 7714 | 谢潮添,陈昌生,纪德华,等. 坛紫菜EST-SSR分子标记的开发及应用[C]. 见:中国云南昆明 2008年中国水产学会学术年会. |
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