题名 | 稻属 AA-基因组物种的线粒体比较基因组学 |
作者 | 刘源 |
学位类别 | 博士 |
答辩日期 | 2013-12 |
授予单位 | 中国科学院大学 |
授予地点 | 北京 |
导师 | 高立志 |
关键词 | 稻属AA-基因组 山茶属 线粒体基因组 叶绿体基因组 基因丢失 比较基因组学 |
学位专业 | 植物学 |
中文摘要 | 稻族 (Oryzeae) 是禾本科中包含重要粮食作物,包括亚洲栽培稻 Oryza sativa 和非洲栽培稻 O. glaberrima 的重要类群,现有大约 12 个属,广布于全球的热带和温带地区,世界大约一半的人口以水稻为食。本研究从稻属-AA基因组物种的二代测序数据中提取线粒体reads,完整地拼接出稻属-AA 基因组的9个线粒体基因组;同时还用基因组reads、从头组装出的基因组序列和实验验证结合检测了 26 个重要的农艺性状相关基因在稻属-AA 基因组 8 个种中得到与丢失的分布式样,还用日本晴 (JAP) 核基因组为参考,分析了PROG1基因同源区段的结构与变异。最后,还对大理茶 (C. taliensis) 和油茶 (C. oleifera) 的2个叶绿体基因组序列进行组装和分析。 |
语种 | 中文 |
公开日期 | 2016-05-31 |
内容类型 | 学位论文 |
源URL | [http://ir.kib.ac.cn/handle/151853/25564] |
专题 | 昆明植物研究所_昆明植物所硕博研究生毕业学位论文 |
作者单位 | 中国科学院昆明植物研究所 |
推荐引用方式 GB/T 7714 | 刘源. 稻属 AA-基因组物种的线粒体比较基因组学[D]. 北京. 中国科学院大学. 2013. |
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